这一次的游戏剧情，比前几作更加丰富，玩起来也更加有趣，即使不少玩家根本无法见到最后的BOSS，不过仅仅听听别人说的剧情，或者看看别人攻略后的游戏CG，玩家们也有着非常浓厚的兴趣。
此次新出的新势力——永远亭中，新角色兔女郎铃仙•优昙华院•因幡还有因幡帝一出场就戳中了无数人的萌点，尤其是在战斗中，那抖来抖去的兔耳朵，是在让玩家想冲进去，亲手玩弄爱抚。
故事中给予剧情背景是中秋，满月月球和地面就能建立起连接通道，因为想躲避月球方面的人，于是八意永琳将整个月球隐藏了起来。
可是这妨碍了幻想乡一群无所事事整天最喜欢开宴会的家伙们赏月，于是好心情被打扰的幻想少女们纷纷讨伐此次永夜抄异变。
华夏中秋神话传说中，就有嫦娥奔月、月兔这样的传说。
于是铃仙以及因幡兔子等，被玩家们理所当然地认为是月兔——因幡帝是兔妖，但是铃仙的自称可是货真价实的月兔兵器。
对于这种神话故事，在华夏人民从小听到大，有着广泛的故事，更有无数的改编小说、电影、电视，对此次的永夜抄中新颖的故事设定，玩家们兴趣极为浓厚。
自然而然，蓬莱山辉夜就被认定是嫦娥——她的设定也跟嫦娥极为类似。
幻想乡的妹子很多，但是在设定上就点名为“绝世美女”的，迄今为止只有两个人，一个是爱丽丝，一个便是此次的辉夜。
这两个人的人设可是花了贺晨不少功夫，他不能学习神主ZUN那样，给个“绝世美女”设定就算完了。毕竟他能动用的资源比神主要多无数倍，更何况，但从画这一方面来说，贺晨自认现在完爆神主一百条街。因此他必须要让画出来的角色，真的让观众们感受到了“绝世美女”的气质才行。
尽管人的审美是不同的，但是总体而言，大众的审美是有一个趋向性。他能画出真正的恐怖，也有把握塑造出被大众主流所接受的“美”。
这里唯一的难点就是，幻想乡的妹子太多了，各个都不俗，贺晨又不可能刻意去丑化自己所喜欢的角色，因此在这么多可爱的角色中间，也要让大多数体会到爱丽丝和辉夜的美，是一件比较棘手的事情。
在画爱丽丝的时候，除了身材之外，贺晨采用的是西方的对五官的审美特点，其一抓住西方玩家的心理，将幻想乡传遍全世界。其二，也是让东方玩家，更能感受到异域风情以及幻想乡那海纳百川似的包容。
在画辉夜的时候，贺晨直接上的是水墨风格，难度很高，贺晨尝试了很久才最终在永夜抄中实现出来，但是效果非常强。水墨画不同于一般的风格，无需任何后期加工，它就自带渲染。
而且其本身就属于华夏的国粹之一，让人一看，就一股浓郁的古朴的华夏风格迎面扑来——这更加印证了辉夜的人设，她可是已经活了千年，这样的风格跟玩家们心目中的形象完美契合，甚至更加强烈。
同时，贺晨增添了一些现代的气息，让玩家们感受都了一种古典和现代相结合，既有强烈的反差，又有种微妙的融合的感觉——这正是幻想乡的风格，神鬼仙妖人，住着古典气息浓厚的房屋，追更着从“外界”带进来的漫画，玩着电脑，看着最新款超大屏液晶电视……
辉夜没有华丽的衣着，绚丽的打扮，可是当玩家们亲眼看到月光下的辉夜之时，才忽然明白，什么叫做沉鱼落雁，什么叫做羞花闭月，网上那些经过PS之后的所谓女神，跟此刻的辉夜一比，如村姑一般。
这种美得让人甚至忘记躲避弹幕的感觉，正如神话传说中的嫦娥——相传，嫦娥就是一个绝世美女。
虽然两人的身份不同，嫦娥本是普通的人类，吃了仙丹才飞入月宫，而辉夜却是月面的公主，犯了禁忌被放逐凡尘。
可是两人的心情是一样的，传说中，寂寞冷清的月宫，只让嫦娥感到孤独与寂寞，她向往凡尘的人烟气息。而在辉夜也喜欢上了地面上的生活，因此才会在躲避接自己的使者，甘愿留在凡尘。
最终的故事，是一个皆大欢喜的结局，最后游戏通关，永琳得知幻想乡本就是与世隔绝的地方，即使她不隐藏月亮，也没人进的来（在没有八云紫的允许的情况下）。于是永琳取消了法术，跟幻想乡众人和解，成为了幻想乡的一员，随后一群人就地赏月开宴会，永远亭付出了招待众人吃喝的代价，作为这次异变凶手的“惩罚”。
可喜可贺，可口可乐。
这里又有一段隐藏剧情，倘若玩家们之前没有跳过BOSS，选择了跟白泽慧音打架的话，辉夜就会诱惑玩家们再去打一个人（触发隐藏任务）。
这个人就是跟辉夜相爱相杀一辈子，明明互相理解、喜欢，却因为傲娇而不敢表达爱意，既能互相打的残肢遍地，又能恢复之后一起喝酒，一起吃肉（肉的来源一直是个谜题）的藤原妹红。
辉夜是因为掌握着永远之力，因此而永生不死不灭。
而妹红开始的时候是个人类，不过父亲曾经向一位身份卑微的女子求婚，却被其出难题羞辱。那女人正是辉夜，于是妹红从那时其就对辉夜怀有敌意。偶然知道辉夜将返回月球，她想报复辉夜，可是最红辉夜还是离开了，而她却拿到了对方留下的一个药壶。
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